研究所及研究中心
中大的學術部門積極參與廣泛的研究領域。大學設有多個研究所及研究中心，於優質的跨學科研究中各有專精。此外，不少院系均設有較小型的研究或諮詢服務單位。大學亦與多個內地及海外學術機構及院校合作，成立聯合研究單位，以結合專才和資源，促進不同學科領域的研究。
研究所
- 人類傳意科學研究所
- 大腦與認知研究所
- 中國文化研究所
- 中醫中藥研究所
- 太空與地球信息科學研究所
- 心腦血管醫學研究所
- 未來城市研究所
- 土地資源與房屋政策研究中心
- 可持續城市研究中心
- 社區與地方管治研究中心
- 城市信息學研究計劃
- 城市歷史、文化和媒體研究中心
- 生物科技研究所
- 光科技研究所
- 何鴻燊海量數據決策分析研究中心
- 呂志和創新醫學研究所
- 心血管基因組醫學中心
- 李嘉誠健康科學研究所
- 亞太工商研究所
- 亞洲供應鏈及物流研究所
- 卓越兒童健康研究所
- 信興高等工程研究所
- 洪克協痛症研究所
- 香港中文大學人工智能交叉學科研究所
- 香港中文大學天石機器人研究所
- 建造與建築學機器人中心
- 香港中文大學健康公平研究所
- 香港中文大學深港創新研究院（福田）
- 香港中文大學賽馬會老年學研究所
- 香港中西醫結合醫學研究所
- 香港亞太研究所
- 香港教育研究所
- 香港量子信息科技研究所
- 香港糖尿病及肥胖症研究所
- 丘中傑糖尿病檢測中心
- 香港癌症研究所
- 腫瘤標誌物實驗室
- 腫瘤擬遺傳學/腫瘤病毒學實驗室
- 癌症藥物測試中心
- 癌細胞訊息傳導研究室
- 消化疾病研究所
- 何善衡腸胃健康中心
- 香港中文大學賽馬會大腸癌教育中心
- 鄭孫文淑肝炎研究中心
- 深圳研究院
- 中國城市住宅研究中心（深圳）
- 中國經濟政策專題研究室
- 中國語文研究中心
- 公共衛生及基層醫療研究所（深圳）
- 代謝疾病和再生醫學實驗室
- 功能基因組學和生物統計計算實驗室
- 可信與智能互聯網實驗室
- 生物工程實驗室
- 生物醫學學院核心實驗室
- 供應鏈整合和服務創新專題實驗室
- 炎症性疾病研究室
- 物理及材料研究實驗室
- 食品研究中心功能食用菌研究室
- 香港中文大學天石機器人研究所（深圳）
- 時空智能與可持續發展實驗室
- 消化道腫瘤生物學及治療學實驗室
- 珠三角社會研究中心
- 航天醫學與工程技術研發與轉化實驗室
- 基因調控與藥物研發實驗室
- 富媒體大數據重點實驗室
- 智慧硬件實驗室
- 無線技術及動態信息實驗室
- 虛擬地理環境實驗室
- 腫瘤表觀遺傳學實驗室（深圳）
- 農業生物技術國家重點實驗室（香港中文大學）深圳基地
- 網路編碼研究所（深圳）
- 語言學，溝通障礙及生物醫學實驗室
- 數字視覺娛樂實驗室
- 膠體與介面化學實驗室
- 臨床試驗及生物統計實驗室
- 醫學核心實驗室
- 醫學影像計算研究中心（深圳）
- 雙語研究與語言障礙實驗室
- 藥用植物應用研究國家重點實驗室（香港中文大學）深圳基地
- 理論物理研究所
- 理論計算機科學與通訊科學研究所
- 組織工程與再生醫學研究所
- 智能設計與製造研究所
- 植物分子生物學及農業生物科技研究所
- 網絡編碼研究所
- 劉佐德全球經濟及金融研究所
- 數學科學研究所
- 環境、能源及可持續發展研究所